Odliczenie VAT z faktury wystawionej poza KSeF

Obowiązek wystawienia e-faktury poprzez KSeF stanie się obligatoryjny w 2026 roku. Jednocześnie faktura jest dokumentem upoważaniający do odliczenia podatku naliczonego. W związku z tym warto zadać sobie pytanie czy możliwe jest odliczenie podatku VAT od faktury wystawionej poza KSeF czyli niezgodnie z przepisami.

Prawo do odliczenia podatku VAT

Jedną z fundamentalnych zasad konstrukcji podatku od towarów i usług jest prawo podatnika do odliczenia podatku zapłaconego w cenie przy nabyciu towarów i usług związanych z działalnością gospodarczą. Warunkiem odliczenia jest m.in. posiadanie przez czynnego podatnika VAT faktury dokumentującej wykonanie czynności opodatkowanej. 

Ponadto omawiane prawo do odliczenia jest uzależnione jest także od niezaistnienia przesłanek negatywnych, określonych w art. 88 ustawy. Przepis art. 88 ustawy enumeratywnie określa listę przypadków, w których podatnik został pozbawiony prawa do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego. Jednakże nie wymienia on przypadku, gdy podatek naliczony wynika z faktur dokumentujących nabycie towarów i usług, wystawionych wbrew obowiązkowi, bez użycia Krajowego Systemu e-Faktur  (w sytuacji, gdy faktura odzwierciedla prawdziwe zdarzenie gospodarcze).

Wystawienie faktury poza KSeF nie pozbawia prawa do odliczenia VAT

Jak wskazał Dyrektor KIS w interpretacji z dnia 4.03.2025 r., nr 0114-KDIP1-3.4012.838.2024.1.MPA, vzynnemu podatnikowi podatku VAT będzie przysługiwało prawo do odliczenia kwoty podatku naliczonego wynikającego z faktur zakupowych dokumentujących nabycie towarów i usług wystawionych wbrew obowiązkowi bez użycia Krajowego Systemu e-Faktur, wykorzystywanych przez spółkę do czynności opodatkowanych w ramach prowadzonej działalności gospodarczej. 

Wystawienie faktur zakupowych wbrew obowiązkowi bez użycia Krajowego Systemu e-Faktur, nie pozbawia podatnika prawa do odliczenia podatku naliczonego, gdyż nie stanowi to negatywnej przesłanki, uniemożliwiającej odliczenie tego podatku, wymienionej w art. 88 ustawy.

Prawidłowe wystawienie faktury papierowej, elektronicznej czy ustrukturyzowanej pod kątem formalnym i materialnym, stanowi spełnienie jednej z przesłanek do skorzystania z prawa do odliczenia. Jej wystawienie bez użycia Krajowego Systemu e-Faktur nie powoduje jednak tego, że wadliwie wystawiony dokument nie stanowi dowodu istnienia prawa do odliczenia podatku naliczonego.